アプリケーションのセットアップの手順といえば、通常はインストールマニュアルを書いてその通りインストールする、という流れをとるが、これが個人・環境ごとに差を生んでトラブルの原因となりやすい。一応、ChefやAnsibleのように、インストールを自動化するツールがあることにはあるが、依存するソフトウェア(やライブラリ・フレームワーク)のバージョン違いまでケアすることが難しい。あるアプリケーションのためにミドルウェアをアップデートしたら、そのミドルウェアに依存していた別のアプリケーションが動かなくなったというのはよくある話である。