次男坊だったため、足利将軍家の慣例通り仏門で入れられ幼少時代を過ごす。将軍家ではこのようにして後継ぎ争いが起こらないようにして、比較的安全に将軍候補をストックしていたのである。だが、将軍だった兄(ソードマスター義輝兄さん)と、その弟の周暠が三好三人衆・松永久通らに殺されてしまい、義昭自身も幽閉される。身の危険を感じた義昭は細川藤孝の助けで脱走し、政治の舞台にカムバックした。