一般的に蟹味噌に用いる蟹は毛ガニであるが、タラバガニやハナサキガニのもある。ちなみに蟹味噌の「味噌」の部分は、中腸腺（蟹や海老などの節足動物で食物の消化と栄養素の貯蔵に大きな役割を果たす器官であり、脊椎動物でいう、すい臓と肝臓の機能を合わせ持つもの）のことである。