昼間の学校で人間に存在を忘れ去られた用具（置き忘れられた傘、落とされたまま気づかれない鉛筆）や口伝（半漁人の噂など）が生徒となり、午前零時に開校する「ミッドナイトホラースクール」に通う様子をえがいたオムニバス形式の物語。存在を忘れ去られたものはいずれ存在自体が消えてしまうため、生徒たちはこの世に「不思議」を作りだし、自分の存在の証を立てることで消滅を防ごうと「不思議」の勉強をしている。作中でこの学校の卒業生が作り出した「不思議」の一例として、物置に忘れ去られていた芝刈り機モッソーによるミステリーサークル、同じく忘れ去られていたライン引きナスキーによるナスカの地上絵などがあげられている。あれ・・・ナスカの地上絵って紀元前2世紀から6世紀に描かれたとかじゃないっけ・・・。 なお、生徒の名前は頭文字をアルファベットから一文字ずつ取っており（ミスターXは例外）、そのため生徒数は全部で26人。と、思いきや・・・。ちなみにこの作品には2種類のOP・EDが存在し、なかでも1代目のOP「Midnight Horror School」はファンの間でも人気が高いが、再放送・およびDVD化の際に全て2代目のOP・EDに差し替えが行われており、CD化もされていないため現在視聴することはほぼ不可能となっている。