元々スパロボαは当初から3部作構想で開発が始まっていた。だがαの好セールスによって、バンプレスト上層部から「ファンディスク的なソフトを作ってはどうか」とという声が上がり、本作の開発がスタートした。しかし開発していくにつれ、ファンディスクではなく一つの作品として作りたいというスタッフの声により、最終的には全45話(イージーとノーマルは43話)というボリュームに仕上がった。